Exploiter le « code chimique » de l’ARN pour établir une carte d’identité tumorale

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L’utilisation de biomarqueurs est fondamentale pour établir avec précision la nature et le degré d'agressivité d'un cancer, ou encore pour adapter le traitement en fonction des caractéristiques moléculaires. Les altérations épigénétiques (qui modulent l’activité du gène mais pas sa séquence d’ADN) sont utilisées comme indicateurs cliniques à cause de leur valeur prédictive ou pronostique.  Dans un article publié dans la revue Analytical Chemistry, les scientifiques présentent une méthode nouvelle, couplant l’analyse des modifications épigénétiques de l’ARN à de l’intelligence artificielle, afin de déterminer le stade d’un cancer du cerveau (le gliome) avec une efficacité inégalée.

En combinant les outils d'analyse de la biologie et l'intelligence artificielle en passant par l'analyse statistique, les scientifiques, de l'IGF et du LIRMM notamment, ont développé une méthode permettant de détecter le stade tumoral d'un tissu cancéreux.

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Référence

Multivariate Analysis of RNA Chemistry Marks Uncovers Epitranscriptomics-Based Biomarker Signature for Adult Diffuse Glioma Diagnostics.
S. Relier, A. Amalric, A. Attina, I.B. Koumare, V. Rigau, F. Burel Vandenbos, D. Fontaine, M. Baroncini, J.P. Hugnot, H. Duffau, L. Bauchet, C. Hirtz, E. Rivals, and A. David.
Analytical Chemistry 6 septembre 2022. doi: 10.1021/acs.analchem.2c01526